Russian Chinese (Simplified) English German

Публикация научных работ

Publication of scientific papers foto Журнал «Проблемы современной науки и образования» выходит еженедельно, по пятницам (в июле, августе - один раз в две недели). Следующий номер журнала № 29(111), август, 2017 г. Выйдет - 25.08.2017 г. Статьи принимаются до 21.08.2017 г.

Если Вы хотите напечататься в ближайшем номере, не откладывайте отправку заявки. Потратьте одну минуту, заполните и отправьте заявку в Редакцию.

linecolor




IN SILICO РЕКОНСТРУКЦИЯ ФУКОИДАН-УТИЛИЗИРУЮЩИХ ЛОКУСОВ МОРСКИХ БАКТЕРИЙ FORMOSA ALGAE, FORMOSA HALIOTIS И WENYINGZHUANGIA FUCANILYTICA

Зуева А. О., Сильченко А. С., Ермакова С. П.

Зуева Анастасия Олеговна - бакалавр, кафедра биоорганической химии и биотехнологии, Школа естественных наук, Дальневосточный федеральный университет;

Сильченко Артем Сергеевич – кандидат химических наук, научный сотрудник;

Ермакова Светлана Павловна - доктор химических наук, заведующая лабораторией,Федеральное государственное бюджетное учреждение науки Тихоокеанский институт биоорганической химии им. Г. Б. Елякова, Дальневосточное отделение Российской академии наук, г. Владивосток

Аннотация: микроорганизмы играют ключевую роль в метаболических процессах различных экосистем. Выявление микроорганизмов и метаболических путей, ответственных за деградацию полисахаридов бурых водорослей, является важным для понимания глобального метаболизма углеводов. Ферментативный аппарат морских бактерий, участвующий в катаболизме сульфатированных полисахаридов бурых водорослей, практически не изучен. В данной работе нами впервые представлен in silico-анализ фукоидан-утилизирующих локусов (FUL) морских бактерий Formosa algae, Formosa haliotis и Wenyingzhuangia fucanilytica. Методом сравнительной геномики определены границы оперонов и их регуляторы, предположена функция некоторых, ранее не изученных белков и предложен путь катаболизма сульфатированных фукозсодержащих полисахаридов морскими бактериями.

Ключевые слова: морские бактерии, геном, полисахариды бурых водорослей, фукоиданы, фукоидан-утилизирующий локус.

IN SILICO RECONSTRUCTION OF FUCOIDAN UTILAZATION LOCI OF FORMOSA ALGAE, FORMOSA HALIOTIS AND WENYINGZHUANGIA FUCANILYTICA

Zueva A., Silchenko A., Ermakova S.

Zueva Anastasiya - undergraduate, Department of bioorganic chemistry and biotechnology, school of natural sciences, Far eastern federal university;

Silchenko Artem – PhD in chemistry, scientific researcher;

Ermakova Svetlana – Doctor in chemistry, head of laboratory, G.B. Elyakov pacific institute of bioorganic chemistry far eastern branch, Russian academy of sciences, Vladivostok

Abstract: microorganisms play a key role in metabolic processes in different ecosystems. Determination of microorganisms and metabolic pathways responsible for the degradation of polysaccharides from brown algae is important for understanding of the global carbohydrate metabolism. Enzymatic machinery of marine bacteria that involved in the catabolism of sulfated polysaccharides from brown algae, practically has not been studied. In present work we describe in silico-analysis of fucoidan utilization loci (FUL) of marine bacteria Formosa algae, Formosa haliotis and Wenyingzhuangia fucanilytica. We identified the borders of operons and their transcriptional regulators, assume the function of some hypotetical proteins and proposed catabolic pathways of sulfated fucose-containing polysaccharides by marine bacteria.

Keywords: marine bacteria, genome, brown algae polysaccharides, fucoidan, fucoidan utilization loci.

Список литературы / References

  1. KusaykinM. I., SilchenkoA.S., ZakharenkoA. M., ZvyagintsevaT. N. Fucoidanases // Glycobiology, 2015. V. 1. P. 1–10.
  2. Li B., Lu F., Wei X., Zhao R. Fucoidan: Structure and Bioactivity // Molecules, 2008. V. 13. P. 1671-1695.
  3. Zonga A., Cao H., Wang F. Anticancer polysaccharides from natural resources: A review of recent research // Carbohydr. Polym., 2012. V. 90. P. 1395-1410.
  4. Hayashi K., Nakano T., Hashimoto M., Kanekiyo K., Hayashi T. Defensive effects of a fucoidan from brown alga Undaria pinnatifida against herpes simplex virus infection // Int. J. Immunopharmacol., 2008. V. 8, N 1. P. 109-116.
  5. Colliec S., JozefonviczA low molecular weight fucoidan fraction from the brown seaweed Pelvetia canaliculata / // The International Journal of Plant Biochemistry, V. 35. № 3. P. 697-700.
  6. Descamps V., Colin S., Lahaye M., Jam M., Richard C., Potin P., Barbeyron T., Yvin J., Kloareg B. Isolation and culture of a marine bacterium degrading the sulfated fucans from marine brown algae // Mar. Biotechnol., 2006. V. 8. № 1. P. 27–39.
  7. Woo-Jung K., Kim S., Lee Y., Kim H., Kim H., Moon S., Suh H., Jang K., Park Y. Isolation and characterization of marine bacterial strain degrading fucoidan from korean Undaria pinnatifida sporophylls // J. Microbiol. Biotechnol., 2008. V. 18. № 4. P. 616-623.
  8. Barbeyron T., L'Harold S., Michel G., Czjzek M. Mariniflexile fucanivorans,.
  9. Chang Y., Xue C., Tang Q., Li D., Wu X., Wang J. Isolation and characterization of a sea cucumber fucoidan utilizing marine bacterium // Lett. Appl. Microbiol.,.№.
  10. Sakai T., Ishizuka K., Shimanaka K., Ikai K., Kato I. Structure of oligosaccharides derived from Cladosiphon okamuranus fucoidan by digestion with marine bacterial enzymes // Mar. Biotechnol., 2003. V. 5. № 6. P. 536-544;
  11. Бакунина И. Ю., Шевченко Л. С., Недашковская О. И., Шевченко Н. М., Алексеева С. А., Михайлов В. В., Звягинцева Т. Н. Поиск фукоидан-гидролаз среди морских микроорганизмов // Микробиология, 2000. Т. 69. № 3. С. 370-376.
  12. Tanaka R., Mizutani Y., Shibata T., Miyake H., Iehata S., Mori T., Kuroda K., Ued M. Genome Sequence of Formosa haliotis Strain MA1, a Brown Alga-Degrading Bacterium Isolated from the Gut of Abalone Haliotis gigantean // Genome Announc., V. 4.№ 6..
  13. ChenChangDongXueWenyingzhuangia fucanilytica.,.
  14. Sonnenburg E. D., Sonnenburg J. L., Manchester J. K., Hansen E. E., Chiang H. C., Gordon J.I .A hybrid two-component system protein of a prominent human gut symbiont couples glycan sensing in vivo to carbohydrate metabolism // ,.
  15. LarsbrinkRogers HemsworthMcKeeTauzinSpadiutKlinterPudloUrsKoropatkinCreaghHaynes Kelly Cederholm Davies Martens Brumer H. A discrete genetic locus confers xyloglucan metabolism in select human gut Bacteroidetes // Nature, 2014. V. 506. № 7489. P. 498–502.
  16. Silchenko A. S., Kusaykin M. I., Kurilenko V. V., Zakharenko A. M., Isakov V. V., Zaporozhets T. S., Gazha A. K., Zvyagintseva T. N. Hydrolysis of Fucoidan by Fucoidanase Isolated from the Marine Bacterium Formosa algae // Mar. Drugs., 2013. V. 11. P. 2413-2430.
  17. Koropatkin MartensGordon Smith. Starch catabolism by a prominent human gut symbiont is directed by the recognition of amylose helices // Structure, V. 16.№
  18. Leite E. L., Medeiros M. G. L., Rocha H. A. O., Farias G. G. M., da Silva L. F., Chavante S. F., de Abreu L. D., Dietrich C. P., Nader H. B. Structure and pharmacological activities of a sulfated xylofucoglucuronan from the alga Spatoglossum schroederi // Plant Science, 1998. V. 132. P. 215–228.
  19. Sakai T., Kimura H., Kato I. Purification of sulfated fucoglucuronomannan lyase from bacterial strain of Fucobacter marina and study of appropriate conditions for Its enzyme digestion // Mar. Biotechnol., 2003. Vol. 5. № 4. P. 380-387;
  20. Youssef N. H., Farag I. F., Rinke C., Hallam S. J., Woyke T., Elshahed M. S. In Silico Analysis of the Metabolic Potential and Niche Specialization of Candidate Phylum "Latescibacteria" (WS3) // PLoS ONE, 2015. V.10. № 6. e0127499.
  21. Michel G., Tonon T., Scornet D., Cock J.M., Kloareg B. The cell wall polysaccharide metabolism of the brown alga Ectocarpus siliculosus. Insights into the evolution of extracellular matrix polysaccharides in Eukaryotes / // New Phytologist., 2010. V. 188. P. 82–97.
  22. Aziz R. K., Bartels D., Best A. A., DeJongh M., Disz T., Edwards R. A., Formsma K., Gerdes S., Glass E. M., Kubal M., Meyer F., Olsen G. J., Olson R., Osterman A. L., Overbeek R. A., McNeil L. K., Paarmann D., Paczian T., Parrello B., Pusch G. D., Reich C., Stevens R., Vassieva O., Vonstein V., Wilke A., Zagnitko O. The RAST Server: Rapid Annotations using Subsystems Technology // BMC Genomics,
  23. 23.Rutherford K., Parkhill J., Crook J., Horsnell T., Rice P., Rajandream M. A., Barrell B. Artemis: sequence visualization and annotation / // Bioinformatics, 2000. V. 16. № 10. P. 944-955.
  24. 24.Petersen T. N., Brunak S., von Heijne G., Nielsen H. Signal P 4.0: discriminating signal peptides from transmembrane regions // Nature Methods.,.
  25. 25.Jones P., Binns D., Chang H.-Y., Fraser M., Li W., McAnulla C., McWilliam H., Maslen J., Mitchell A., Nuka G., Pesseat S., Quinn A. F., Sangrador-Vegas A., Scheremetjew M., Yong S.-Y., Lopez R., Hunter S. InterProScan 5: genome-scale protein function classification // Bioinformatics, 2014.
  26. Yin Y., Mao X., Yang J, Chen X., Mao F., Xu Y. dbCAN: a web resource for automated carbohydrate-active enzyme annotation // Nucleic Acids Res., 2012.

 

Ссылка для цитирования данной статьи

Publication-of-scientific-papers-copyright    
Зуева А. О., Сильченко А. С., Ермакова С. П. IN SILICO РЕКОНСТРУКЦИЯ ФУКОИДАН-УТИЛИЗИРУЮЩИХ ЛОКУСОВ МОРСКИХ БАКТЕРИЙ FORMOSA ALGAE, FORMOSA HALIOTIS И WENYINGZHUANGIA FUCANILYTICA// Проблемы современной науки и образования  № 5 (87), 2017. - С. {см. журнал}.

Publication of scientific papers 2

 

 

 

 

FEEDING STURGEON WHILE CULTIVATION IN POOLS

Sagidoldina Zh., Rysbekova A.

Sagidoldina Zhanar Ermekovna – master of agricultural science, senior lecturer;

Rysbekova Alua Manatbekovna – master of chemical technology of inorganic substances, Department of physiology, morphology and biochemistry, Kazakh national agrarian university, Almaty, Republic of Kazakhstan

Abstract: the article analyzes irrational use of biological resources of the Caspian Sea, poaching led to the fact that the number of sturgeon has dropped to a critical level. In this situation, it is important the development of commercial sturgeon breeding, which includes the restoration of commercial sturgeon stocks due to the introduction in the hatcheries Republic of Kazakhstan breeding and cultivation technology of sturgeon, as well as the formation of their broodstock. Basin method - the cultivation and maintenance of larvae, fry and fingerlings of sturgeon fish in hatchery trays and basins of water using gravity or motorized water pumps. Necessarily it is necessary to arrange additional lighting: on each pool at a height of 2-3 meters are installed two fluorescent lamps of 60 watts.

Keywords: Sterlet Acipenser ruthenus L., juveniles, fingerlings, two-year individual, survival, pools, ponds, repair herd.

КОРМЛЕНИЕ ОСЕТРОВЫХ РЫБ ПРИ ВЫРАЩИВАНИИ В БАССЕЙНАХ

Сагидолдина Ж. Е., Рысбекова А. М.

Сагидолдина Жанар Ермековна – магистр сельскохозяйственных наук, старший преподаватель;

Рысбекова Алуа Манатбековна – магистр химической технологии неорганических веществ, кафедра физиологии, морфологии и биохимии, Казахский национальный аграрный университет, г. Алматы, Республика Казахстан

Аннотация: в статье анализируется, что нерациональное использование биологических ресурсов Каспийского моря браконьерский лов привели к тому, что численность осетровых снизилась до критического уровня. В сложившейся ситуации важным является развитие товарного осетроводства, которое включает в себя восстановление промысловых запасов осетровых рыб за счет внедрения на рыбоводных предприятиях РК технологий разведения и выращивания осетровых, а также формирования их ремонтно-маточных стад. Бассейновый метод – выращивание и содержание личинок, молоди и сеголеток осетровых рыб в рыбоводных лотках и бассейнах с использованием самотечного водоснабжения либо с механической подачей воды насосами. Обязательно необходимо организовать дополнительное освещение: над каждым бассейном на высоте 2-3 м устанавливаются две лампы дневного света мощностью 60 Вт.

Ключевые слова: стерлядь Аcipenser ruthenus L. молодь, сеголетки, двухлетки, выживаемость, бассейны, пруды, ремонтное стадо.

 Список литературы / References

  1. Vasilieva L. M., Yakovlev A. P., Shcherbatova T. G. and others. Technologies and standards on commercial sturgeon breeding in the aquaculture zone VI. -M .: publishing house VNIRO -100 2006 pages.
  2. Vasilieva L. M., Ponomarev S. V., Sudakova N. V. Feeding of sturgeon in industrial aquaculture. - Astrakhan: SPC of Sturgeon Culture "BIOS", 2000. 87 p.
  3. Vasilieva L. M., Abrosimova I. A. Biological and technical rationale for the organization of commodity farm in growing sturgeon. Astrakhan, SPC on Sturgeon Culture "BIOS", 2000.
  4. Kozlov V. I., Abramovich A. S. Commodity breeding of sturgeon. M: Rosselizdat, 1986.117 with.
  5. Collection of normative-technical documentation for commercial fish farming. T. 1. M.: Agropromizdat, 1986. 261 pages.
  6. Guidelines for chemical analysis of surface waters of land. L .: Gidrometeoizdat, 1977. 541 p.
  7. Chebanov M. S. Guidelines for the artificial reproduction of sturgeon. Ankara: FAO, 2010. 645 p.
  8. Bogeruk A. K. Breed and domesticated forms of sturgeon (Acipenseridae). M.: Federal State Unitary Enterprise "Federal Selection-Genetic Centre for Fish", 2008. 152.

Ссылка для цитирования данной статьи

Publication-of-scientific-papers-copyright    
Сагидолдина Ж. Е., Рысбекова А. М. КОРМЛЕНИЕ ОСЕТРОВЫХ РЫБ ПРИ ВЫРАЩИВАНИИ В БАССЕЙНАХ // Проблемы современной науки и образования  № 4 (86), 2017. - С. {см. журнал}.

Publication of scientific papers 2

ЕВРОПЕЙСКИЙ ПОДХОД К УСТОЙЧИВОМУ РАЗВИТИЮ СЕТИ ОХРАНЯЕМЫХ ПРИРОДНЫХ ТЕРРИТОРИЙ

Гарбузова Т. Г.

Гарбузова Таисия Георгиевна - кандидат сельскохозяйственных наук, доцент, кафедра бухгалтерского учета и аудита, Санкт-Петербургский государственный лесотехнический университет, г. Санкт-Петербург

Аннотация: статья посвящена определению основных направлений по совершенствованию существующей сети охраняемых природных территорий, созданию и поддержанию глобальной сети всеохватывающих, эффективно управляемых и экологически представительных национальных и региональных систем охраняемых территорий, которая позволит подключиться к работе по созданию Общеевропейской экологической сети, а также эффективно способствовать снижению темпов потери биоразнообразия, поддерживать экосистемные услуги, удовлетворять жизненные потребности местного населения, создавать возможности для отдыха и туризма.

Ключевые слова: охраняемые природные территории, устойчивое развитие, сохранение биоразнообразия, экологическая сеть.

EUROPEAN APPROACH TO SUSTAINABLE DEVELOPMENT OF PROTECTED AREAS NETWORK

Garbuzova T.

Garbuzova Taisia – PhD in Forestry, Associate Professor, accounting department, Saint-Petersburg state forest technical university, Saint-Petersburg

Abstract: article is devoted to the definition of the main directions for existing nature protected areas network improvement. Creating and maintaining of the global network encompassing, effectively managed and ecologically representative national and regional systems of protected areas, which will allow to connect to the work of the Pan-European Ecological Network creation and effectively reduce the rate of loss of biodiversity, maintain ecosystem services, to meet the vital needs of local communities, provide opportunities for recreation and tourism.

Keywords: nature protected areas, sustainable development, biodiversity conservation, ecological network.

 Список литературы/ References

  1. Гарбузова Т. Г.Современные направления по совершенствования сети охраняемых природных территорий// Актуальные проблемы развития высшей школы, 2010 г. C.36-39.

Ссылка для цитирования данной статьи

Publication-of-scientific-papers-copyright    
Гарбузова Т. Г. ЕВРОПЕЙСКИЙ ПОДХОД К УСТОЙЧИВОМУ РАЗВИТИЮ СЕТИ ОХРАНЯЕМЫХ ПРИРОДНЫХ ТЕРРИТОРИЙ // Проблемы современной науки и образования  № 4 (86), 2017. - С. {см. журнал}.

Publication of scientific papers 2

 

НАСЛЕДОВАНИЕ И ИЗМЕНЧИВОСТЬ ПРИЗНАКА «КОЛИЧЕСТВО КОРОБОЧЕК НА РАСТЕНИИ» У ГИБРИДОВ F1-F2 СОРТОВ G. BARBADENSЕ L. / INHERITANCE AND VARIABILITY OF THE TRAIT "THE NUMBER OF BOLLS PER PLANT" ON THE F1-F2 HYBRIDS OF NEW VARIETIES OF G.BARBADENSE L.

Чоршанбиев Нурали Эсонпулатович / Chorshanbiev Nurali - младший научный сотрудник, Институт Генетики и экспериментальной биологии растений Академия наук Республика Узбекистан, г. Ташкент, Республика Узбекистан

Аннотация: в данной статье изложены результаты по изучению наследования и изменчивости признака «количество коробочек на растении» у гибридов F1-F2 новых сортов G.barbadense L. Показаны эффекты общей комбинационной способности сортов и константы специфической комбинационной способности гибридов. В результате исследования выяснилось, что у гибридов F1 тонковолокнистых сортов хлопчатника признак «количество коробочек на растении» в основном наследовался по типу сверхдоминирования с проявлением положительного гетерозисного эффекта. Сорт Термез-32, имеющий высокие показатели общей комбинационной способности по количеству коробочек, может быть использован в селекционном процессе в качестве донора большого набора плодоэлементов на куст. По сравнению с исходными сортами, у их гибридов F2 наблюдается большой размах изменчивости с появлением лево- и правосторонней трансгрессии. Наличие правосторонней трансгрессии и сравнительно высокие показатели h2 у некоторых комбинаций F2 позволило отобрать ценные генотипы, имеющие большое количество коробочек на куст, для последующих генетико-селекционных исследований.

Abstract: in this article it was given the results of research on studying of inheritance and variability of the trait "the number of bolls per plant" of the F1-F2 hybrids. It was shown the effects of general combining ability of varieties and the constant specific combining ability of the hybrids. It has been clarified in the experiments, that the hybrid F1 of new varieties of G.barbadense L of the trait "the number of bolls per plant" was mainly inherited by the overdominance type with positive heterosis effect. The variety Termez-32 had high levels of general combining ability by “the number of bolls per plant” and it can be used in the breeding process as a donor of a large set of traits of “bolls per plant”. In comparing with the initial varieties and in their F2 hybrids it was observed a large range of variation with appearing of left- and right-sided transgression. Presence of right-transgression and relatively high rates of h2 in some combination of the hybrids F2 allowed to select combinations of genotypes that have a large number of bolls per plant for further genetic and breeding research.

Ключевые слова: хлопчатник, сорта, гибриды, признак, наследование, гетерозис, общая и специфическая комбинационная способность, изменчивость.

Keywords: cotton varieties, hybrids, sign, inheritance, heterosis, the general and specific combining ability, variability.

Литература

  1. Автономов В. А. Изменчивость, наследуемость штапельной длины волокна у экологически отдаленных гибридов F1-F2 хлопчатника G.barbadenseL. Материалы международной научно-практической конференции посвященной 95-летию Саратовского госагроуниверситета. Часть 1. Саратов ИЦ «Наука», 2008. С. 3-4.
  2. Автономов В. А, Кимсанбаев М. Х. Наследование числа коробочек и продуктивности хлопка-сырца одного растения у географически отдаленных гибридов F1-F2G.barbadenseL. / Ж. Вестник Аграрной Науки Узбекистана. № 4 (22). Ташкент, 2005. С. 31-37.
  3. Доспехов Б. А. Методика полевого опыта (с основами статистической обработки результатов исследований). Москва. Агропромиздат, 1985. 347 с.
  4. Allard R. W. Principles of plant breeding. John. Willey, Sons. New York London – Sidney, 1966.
  5. Griffing B. I. Concept of general and specific combining ability in relation to diallel crossing systems. Austr. Journ. Biol Sci., 1956.

Publication of scientific papers

Старый сайт

oldsite Старая версия сайта >>>

Рейтинг@Mail.ru
Яндекс.Метрика
Импакт-фактор российских научных журналов
 

Контакты

  • Адрес: 153008, Россия, г. Иваново, ул. Лежневская, д. 55, 4 этаж. Время работы: с 10-00 до 18-00. Кроме выходных.
  • Tel: +7(910)690-15-09
  • Fax: +7(910)690-15-09
  • Email: Этот адрес электронной почты защищён от спам-ботов. У вас должен быть включен JavaScript для просмотра.
  • Website: http://www.ipi1.ru/
  • Вконтакте: http://vk.com/scienceproblems
Вы здесь: Главная Статьи 03.00.00 Биологические науки